一、流體動力效應：主要為激光激發水分子產生高速動力的流體力學。水分子極易吸收此一波長的激光能量，卻不至于破壞水分子的鍵結結構。若其激光能量撞擊到水分子，則可使水分子激發成為具有高速動能的狀態，此一流體動能便能達到組織切割的良好效果，即是采用水分子作為組織切割之媒介。
二、溫度效應：軟組織之切割主要以此效應來達成。組織吸收激光能量后溫度會升高，當溫度在370C至600C時組織不會產生變化，一旦超過600C時即開始凝固，可達到止血的效果，當溫度超過1000C，細胞間的水分會被蒸發，剩下脫水的組織超過2000C以上時會被碳化。
三、機械效應激光切割機硬組織的能力不是來自溫度效應，而是藉由能量將組織中的水蒸發造成組織內壓力增高，在硬組織熔點未到達之前就造成組織的破裂，這個現象特稱之為微爆發 ，和溫度效應無直接相關。
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